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科学家提出了一种新的命名系统 用于未培养的细菌和古细菌

根据来自全球119位微生物学家支持的一项新的共识声明,为细菌和古细菌分配科学名称的长期规则已经过期。

细菌和古细菌(缺乏细胞核的单细胞生物)构成了地球上三个生命域中的两个,并根据国际原核生物命名法(ICNP;该法典)进行命名。目前,该规范仅识别可以从实验室文化中培育出来的物种-对于研究野外细菌和古细菌的微生物学家而言,这一要求长期以来一直是个难题。

自1980年代以来,微生物学家一直使用遗传测序技术从环境中直接采样和研究微生物的DNA,这些环境遍及从地球冰冷的海洋到深层地下矿山再到人类皮肤表面的各种生境。对于这些物种中的绝大多数,尚无在实验室中进行培养的方法,因此,根据《守则》,不能正式命名它们。

艾莉森·默里(Alison Murray)表示:“近年来,从环境中收集的古细菌和细菌的基于基因组的发现激增,但没有正式的系统对其正式命名,这在该领域造成了很多混乱和混乱。”里诺沙漠研究所(DRI)生物学博士,博士。“能够用一种共同的语言来代表其基因组序列所知的未耕种生物的多样性非常重要。”

在本周发表在《自然微生物学》杂志上的一篇文章中,穆雷和她的合作者介绍了更新有关命名细菌和古细菌新物种的现有法规的理由,并提出了两种可能的发展途径。

作为第一种选择,该小组提议正式修订该规范,以包括以DNA序列信息表示的未培养细菌和古细菌,以代替当前所需的活培养物样品。作为替代方案,他们建议为未栽培的生物创建一个完全独立的命名系统,该体系可以在将来的某个时候与《守则》合并。

内华达大学拉斯维加斯分校生命科学教授Brian Hedlund博士说:“对于这一领域的研究人员而言,采用上述两种方法中的任何一种都会带来巨大的好处。”“我们将能够创建一个统一列表,列出过去几十年来发现的所有未栽培物种,并为如何命名新物种以及何时命名实施普遍质量标准。”

例如,使用DNA测序研究人类微生物组的研究人员,即生活在体内和人体上的成千上万种细菌和古细菌,将有一种方法为他们确定的尚未代表的物种分配正式名称。在文化收藏中。这将提高世界范围内的研究人员就诸如不同人群的饮食与肠道细菌之间的联系等主题开展协作研究的能力,或者以先前的研究为基础。

波特兰生物学教授Anna-Louise Reysenbach博士说:“它为提供一种结构化的方法,为在科学界内部和整个公共领域交流微生物世界中尚未开发的广阔生物多样性奠定了基础。”州立大学。“这就是为什么这种变化如此重要的原因。”

本文和拟议的计划是由美国国家科学基金会资助的一系列研讨会的最终成果。默里说,下一步是找出实施战略,以推进两个拟议计划中的一个,同时让许多为这一共识声明做出贡献的微生物学家以及世界各地希望帮助实现这一改变的其他人参与进来。到目前为止,许多人都渴望参加。

穆雷说:“这是一个令人兴奋的领域,因为我们正在描述地球上的生物多样性并发现新的门,就像科学家回到1800年代时仍在发现更大的生物一样。”“许多范式一直在改变我们对世界运作方式的理解以及那里存在多少多样性-这是需要做出的另一种改变。我们将需要改变它,否则我们将要改变。生活在混乱中。”

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