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李斯特菌蛋白提供CRISPR杀伤力开关

来自土壤中常见细菌菌株的单一蛋白质将为科学家提供一种更精确的RNA编辑方法。

康奈尔大学,洛克菲勒大学和纪念斯隆·凯特琳癌症中心的最新研究发表在7月3日的《科学》杂志上,该蛋白质称为AcrVIA1,可以终止CRISPR-Cas13编辑过程。

共同作者马丁·维德曼(Martin Wiedmann)博士说:“我们正在扩展科学工具箱,以有效使用CRISPR而不会引起副作用。”'97年,盖勒特(Gellert)家庭食品安全教授,康奈尔大学(Cornell)食品安全实验室和牛奶质量改善计划主任。“由于这种细菌,我们有机会关闭并增强对RNA进行改变的能力。”

CRISPR,或成簇的规则间隔的短回文重复序列,是一种实验室机制,可以像显微剪刀一样起作用,并精确地编辑DNA中包含的基因。在当今使用的六种类型的CRISPR中,CRISPR-Cas13可以编辑RNA,迄今为止,RNA在编辑过程中缺乏制止作用。

科学家们说,由于导致COVID-19病的冠状病毒SARS-CoV-2是一种RNA病毒,因此这种新的编辑附件可能对冠状病毒研究人员有用。

主要作者Alex Meeske是洛克菲勒大学教授,高级作者Luciano Marraffini实验室的博士后研究人员,他怀疑李斯特菌中的蛋白质(噬菌体)可能对RNA编辑有用。

在研究开始之初,Meeske与食品安全专家Wiedmann取得了联系,以从他的食物病原体收集物中获取遗传细菌样本。魏德曼实验室的博士生廖景秋将研究范围从大约1,500个细菌候选者缩小到62个菌株。

Wiedmann实验室将这些样品转移到了洛克菲勒,在那里实习生爱丽丝·卡塞尔(Alice Cassel)对62个菌株进行了测序,并分离了20种候选蛋白质。

一种菌株脱颖而出:李斯特菌Seeligeri,一种在土壤中到处可见的无害细菌。不像它的强大表亲(食源性单核细胞增生李斯特菌),它不会引起人类疾病。

洛克菲勒大学的科学家发现,源自L. seeligeri的蛋白AcrVIA1立即停止了CRISPR编辑过程。Meeske说:“ AcrVIA1在控制Cas13的应用中非常有用。任何Cas13编辑的东西,这种抗CRISPR蛋白都可以关闭。”“这是您可以在CRISPR编辑过程中使用的'kill switch',它已成为我们可使用的其他工具。”

维德曼解释说,科学家现在可以用更严格的手段研究RNA问题。他说:“这种工具使我们更加精确。”

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